Dataset for CDS MCL-1 of organism Cyprinus carpio

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
***  **       ***** ****    * **** *  **      * *** *  ** *    * *   *  ***  ** 
ATGttTC------cTGGGAgTAAAgtttCaAACGaCaaCG------GcCTTtGgcCAtGcattGgAataGcaGCTctTAa
   ac  taagttt     t    ---- g    g cg  ttgagt t   c cg  a gcgc c cac tc   tg  c

        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*   * *  *     *** ** *     *  ** * ***                  ** ***** *       **   *
C---GtCaaC-----AACaGCtC-----GagCGgGtTTGgt----------------CGcAAGCCaCtagtaatGCcagA
 cgg c cg gctca   c  g acgga ga  a c   acgggtacgcggatgaca  g     g -------  tga 

       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
 ***   * **** * ****   * * * * **   *                    *** ** ***  ***  *  * *
aCCG--aAaGCCCaGaACGA---GtTcGcAgGGaacG--------------------GTCtGCaGGGctCGGtaCcaTcC
g   ccg g    g g    acg c t a a  gct cagctggacgggcggttcgt   c  g   ga   ct tc a 

       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
 ** *     *****    ****  * * *               * ** **  *** *  **********  ** ****
tCGcCtgagtCGGACtgcgAGGAaaTaGtTgattacagccccgtcTgCGcCGctCTGgAaaTGGACACGCGcgAGaTTAT
-  g caccc     ccga    gc g g --------------- c  t  ag   c tc          gc  c    

       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
 *   ****   *   * **  *** ***     ***  *   *   *** *  *  *  *      ** * ** **** 
-TgacATTTtctTaaaAaGCttCACaGGAc----TCCctCattCtaaAAGtGgaAaaAaaCagatccTAtCtACgATGAa
g tgg    cta cgc c  -a   g   atgtg   gc gga cgg   c tc tc cg g----t  c g  a    g

       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*** ** **   ***** **   ** * ****** *  *  ********** *** ***** ** *** * *****    
GCGgGTtGT---GGACAgTCtcgTGgTgAAGCACgAatTggCTTACAAAGGtATGaTTGCA-CGgCTGaAtCTGGAggag
   c  c  cgc     t  ---  a a      c ga ca          a   -     g  t   c g     ctct

       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
 **   ** **  **** **  ***    * * ** *      * ****  **   ** *** ******** ** ** * 
aAAggaGAaGAtgTGAGtTTtgTCAagacTgTgGCaAcagagcTcTTCAgcGAtggCAtCACaAACTGGGGgCGcATtGc
c  ccg  c  ca    c  ca   gctg a a  c agacca g    ag  cca  c   g        c  g  c t

       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
 ** *** ** * ** ** *** * ** **** *** *  ** *      * ****  *      **** ***     **
cAGcCTGcTGaCtTTtGGgGCCaTtGTaTGCAaGCAtCaaAAtG------AtAGAGgaCttagcaAGTGtGTGagtctGG
g  t   g  g g  c  a   g g  g    c   g tg  g agctgc g    ag ------    c   gaggc  

       650       660       670       680       690       700       710       720
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
***  **  ******* ********  ** **** ** *   ************* *****    *** **** **** *
TGGggGAagAGATCTCtTCCTATCTtcTCaCAGAcCAaCggcACTGGCTGCTCAAaAACAAagcaTGGgATGGcTTCGaG
   cc  gc       c        ga  t    a  g acg             c     gagc   c    a    t 

       730       740       750       760       770       780       790       800
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
** *******  **   ***    ***   *  **  * * ***  *******  ***   * * ***     * ** **
GAaTTTTTCCatGTcccGGAtacaGAGggaGctGTgaGaAaCGCatTGATGGCcaTTGgtaGtTtTGCaacatTcGGaGC
  g       gc  gga   cgtg   tct tg  tc c g   tc       tg   tgg a g   tggga t  c  

       810       820       830       840       850       860       870       880
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
 *  ** ***    **** *                                                            
tGcaCTtGCTtattTGATaC------------------------------------------------------------
c gt  c   ctcc    c ggccatccgtggggtctaatgaggactatggtaatgacacacacagggcctcacctgatc

       890       900       910       920       930       940       950       960
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                                                                
--------------------------------------------------------------------------------
ctccagctcactgtggcagcacctgctgtggttacctgagccaggctgttaaactcagtggaatacaggtaaagccatgt

       970       980       990      1000  
....:....|....:....|....:....|....:....|..
                                     * * *
-------------------------------------GgTgA
gacaacacatgtactaatctgcacattcttgttctat a a 
© 1998-2023Legal notice