Dataset for CDS BAX-like of organism Amphilophus citrinellus

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                         **                                    *
atgga-atc-tgcg--ca-ctc-tctgtg-----------tTTgcttcagagg------aa------------------A
-----g---t----ag--t---t-----acagtgggaacta  ttgctta---tcttgg--gtgtttgatcgctcgctg 
   t cgggc cat   cgg gc  a   a  ca     c     c  g   cg  g a c        c  a    cc 
     a   a        a   a                      a                                  

        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*           *    *                                                 *   * * *    
Ct----------TggtgTctcaggccaa---gctgtgcagagact-catcca-tccag-ctcaacc-GaacGtGtTcgga
 cgacaaggagc cagc ac--------tgc--------------a------t-----g-------t tgt g a gacc
    a               g  tatgcg  aa a   tcgctt  tc tttg g  tc agcc ag gc          
                            a                       c     a       a             

       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
       *  *                       *    *     ****  * *    *                     
tggttcaAgaCtgagcacg---gtctttctgtgtCgagtGaggctCTGGgtGgAatgtC---------------------
gacacgg cc a------cctaaatgggtaccca ctcg gacag    ca a gg-c agctgactgaccggatccata
c    a       gt a c   ac ca      aga  c a            ca    a   aca  aaa a   c 
                                                                                

       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                       * *      * *  ****** *  *                       * ** *  *
---------------gtaggtgcTgCtgtggcTtGgtGATGAGtTggA---------------------tcGgAAtGttG
agtgaaagaggttgttgtctgct t gccata g cg      c aa gtgtcttcgtcctactttgtacg t  c cg 
 aac     ac g cacc ca     a a    a  c              ca a ag  c a g     a a     c 
                a                   a                                         a 

       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  *  **       **                            **    **  *    ** **     * ** **  * 
cgCttCAgctgatgATcacagtggcttcggagagcttggtttcgGAtgtcTTccTggctGTgGCaacagAgATtTTctCa
ac gg  aggccac  ttatcatttgctacttgatggtacgcac  cact  ta cagg  c  tgtta c  c  tg t
    c   a a     ag c  c  caa  g    ccc  aa a             ac  a  c g            c
    a                              a                      a                     

       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
   **     * *  *****     * **  *  * *      * **        *        *   * *         
gctGGca---TcAccTGGGGtagggTgGTttCccTgTtcgctgTgGCttgaggctTggtagtggActgTgTtagccccgg
aaa  tgaat t aa     ccaaa t  gg tt c attact t  ggatccac cacgtaca ggc c cgtaaaaca
     a     a        a           aa     c ac a  c  ca    a  ca    a     acc    a 
                                               a                                

       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
   *   *  *   *    *   *  *     *        *     *  *  *     *      **** *        
tcaTccaGctAttgTccgaAtcaTtgTcgactGgatggtggAgtttgTccGcgAgcatcTgatcacCTGGcTcaagaggc
cat ttt ag cga taat cgt ca tatta tgctcgtc cgacc ta ga attgg cgctga    t ggtagaaa
a        c ac  a  c   g  g g   cc ca a  a   a      agc   ca c     a a g c   
         a  a                                                                   

       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  ** ** ****      *       *   *       *   *                                     
gaGGaGGcTGGGtgggtgTtacttagTgctTtgtgacgAcggAcctcggtgtcgattgta--------------------
ag  t  g    aaaaga gc-gagc atg gtgcta- ttc tgctacctgtcgcgcggactggctgttgtctgctttt
    g              c gc ca  g        c ac  gaag  acc   a aac        gca  ca cg c
                   a  a                            a                            

       650       660       670       680       690       
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:..
       *           *              *      *            * *
gtttcctTcgcgtacttccTgacca------ttgTttacttCctgcgggagctgTgA
tgggttg gagagtggagg cgagtcggtctcgc ccttga agtaacataaga a 
 ca  ac a a cga     a   g  c aga   a   c    c  a    c    
 a                                     a            a    
© 1998-2024Centre National de la Recherche Scientifique logoInstitut national de la sante et de la recherche médicale logoUniversité de Lyon logoLegal notice