Dataset for CDS adenoviridae of organism Human adenovirus A serotype 18
[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]
10 20 30 40 50 60 70 80 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ****** ** ***** * ** * ** * * ***** * *** ATGGAGttgGA------AGCTGtGtTGggA--------------------------AGtTgT-gAGGGCgTtggTCA--- cca cgtccc a c ca ttacatgctggattacatggcaatgc c a gc a gcc cga 90 100 110 120 130 140 150 160 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** **** ---------GCttTTAC--------------------------------------------------------------- ggagggttt ac tcgctggcgcggcctttgaccatgccgcgactgccaacgttgcaggaggaggagctggagcag 170 180 190 200 210 220 230 240 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** ** * ** ** ***** * -------------------AGTgtACcTgtAAcAA-------------------CACTTgA------------------- cgggaccctgcggcggaga aa a cg a caggtgcaagaaggccatg c ccctgaggaagggcccagc 250 260 270 280 290 300 310 320 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| **** ** * * ** **** * **** ** -----------------------------------GGTTtTTgG--gGcTAtCTGT-----TtgtGTCTcgtttgtGC-- tgtgcagctgttaacattaagcgggaacgggaaac c a taa a g taata aag accccac tt 330 340 350 360 370 380 390 400 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ** ** ** * **** ** * **** * * * ***** -gAAgttGTgtATtGG--------GtAAAAtgAG-------------------------AgTACAgGtAtGgtTTTGAgc aa acg ac a caggaact c ga tttcagcaaggagatatgcatttac c a a g aa aa 410 420 430 440 450 460 470 480 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** * *** ** ** ** ** * * ** * * ***** ActTActggCtggCTGtttAGgGCtTTtGGcA--------------TcTTtAgAttTTTGC------------------- aa aaaa cca gcc a c g a gatattgagagtgc a a a cc aaagttagctttacgccct 490 500 510 520 530 540 550 560 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** * * * ** ** * ** * **** *** *** * -----CAgCtcTcgAtTTtttAAgAgAA--------------------------------AgTGGTgcAATctTTGggtT gatcg c aa aa a agc a c taactattgcttcatatgcttacattattggt a ca aa aag 570 580 590 600 610 620 630 640 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** ******** * *** ** * * ----------------------------TtTCgtcTGCAGGGC-----------------------GggCGG--TTgCtT ggatacaagtgacagggttgctttcaga g aca atgggtcctggggtggtggggtt aa ta a c 650 660 670 680 690 700 710 720 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** * **** ** * * ** tTAT---------------------------------TgCTTTtTTtGtAgCC--------------------------- c taatgttagatttgctggagacaaatttaaagg a g g a a aacaccagccttgttttgcatggtgtt 730 740 750 760 770 780 790 800 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ** *** ** ** ** **** * --------------------------------GTtTTgGATtAAt----------GGgGCtgtACGTtttA--------- tattttcttaattttagtaatacttgtgtgga c a a ggtttccgcaa a cag ccc tggttgtag 810 820 830 840 850 860 870 880 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** *** * * * * **** * * ** * -----------------------------------------------GCTtgtTTG-GgAtTgCgTGCTgGctTtcATtG gaggggtttagtaggcagaccaaaaagtaaaatgtctgtaaaaaaat gag a a a a a a ac aa g 890 900 910 920 930 940 950 960 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ********* *** **** ****** -------------------------tAATGCAGCT------------------------GTGgAGGGcATGGCT------ tggagggggatgcgcatattagacac tcagaaaatacatgttttgttcta a a gtttta 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** * **** ** **** * * ---CACgA----------GGAGtGT----------------------------TTGCgtTtAt----------------- agg a tatggtttgt g ccgatcaatctgcgcgccgttatgttac ac g cggaaattgtcatgcctt 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ******** ---------------------------------TCGCTGGC--------------------------------------- aaaaactattcatgttgtgagccatgttaaaca ctgtgtgtgatcataatatgtttatgcgttgttccatgc 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| -------------------------------------------------------------------------------- atttaggcttaaggcgtggcatgtttgtgccttttcaatgtaaccttagtcatacaaatgtattgcttgaacctgaggtg 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** ******* *** * *** * ** ---------------------GgGGtgTTTGACC------------------------------ATGctGctACT-GtCA ttttctagaataagtttaaat c cc tgtctgtggaattgtataaggttataagat ac ag c c 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ***** * * * ** ***** ** ** * ** ** *** * cCGTTGtcGgcgGtGtgggTGtgGCAGC--------GGgACtCtGC-------------------------gGCtGAGgA a ca aaa a gaac ga agtcatct a c c cctgttttattgaatgtgacggagga g a 1370 1380 1390 1400 1410 1420 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....: **** GTGA------------------------------------------------------------- ccaccttaccttatcttgcctgcgaactgactacgaatccagtgatgaagacggcaactaa |