Dataset for CDS adenoviridae of organism Human adenovirus 21a
[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]
10 20 30 40 50 60 70 80 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ***** * ***** * * * ****** * ATGGA-----------------------------GtTTTGGgtT----------------------AtCtTGGAAGgCtt tccgccaaacccacttcagcaagggatac g ac tcatagcagcagctttgtggag a a a cc 90 100 110 120 130 140 150 160 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ** *** * * **** ** ***** * ***** * ** * **** GcA--gGAttAGGctAcTgtTAGAttAC-----------GCCTCtG--GGAGTctCtGGgtTtttGAGA----------- a aca cg ac a cc aa tggccagtgca g ac ag a ca acg cacccaccggc 170 180 190 200 210 220 230 240 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ****** * ****** * ***** -----------TTCTGG-------------------------------------------TtCGGTGGtGgtgTAGCTg- catgccagcgg aggaggagcagcaggaggacaatccgagagccggcctggaccc c a aac aa 250 260 270 280 290 300 310 320 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * *** *** *** * ***** -----------------GgCtgGTGtTTA-----------------GGAtAggACAGGg--------------------- cctgtttcctgaactgc a ga c ctaggtctacgtccagt c aa agcattaagagggagaggaatc 330 340 350 360 370 380 390 400 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** ***** **** * ** * **** *** * * * * **** ** ** CTAgtGGGAAtAATTtgAgAAgttA-TTGGctttcAGTttA---------gGgCtTttTGAAgCTgTT------------ ca g ca a ccg g acgaa cc atgagccgta a g cc a c tggtggcatgag 410 420 430 440 450 460 470 480 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * -------------------------------------------------------------------------------A gttcagagcgaaggcagggatgaagtttcaatattgcaggagaaatattcactagaacaacttaagacctgttggttgg 490 500 510 520 530 540 550 560 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ** ****** *** * ** **** ACtTG----------------GGCCATtAGG-cTtATttTAAG------------------------------------g c aggatgattgggaagt c aa c gc atatctctgaggcctgataaacagtatagaattacta 570 580 590 600 610 620 630 640 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ***** * AGAAGgT------------------------------------------------------------------------- a taatattagaaatgcatgctacatatcagggaacggggcagaggttataatagatacccaagataaaacagct 650 660 670 680 690 700 710 720 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ***** * * **** *** ---------------------------------------------------------TTTATgAgTtTTAGgTTT----- tttagatgttgtatgatgggtatgtggccaggggttgtcggcatggaagcagtaaca c a a a aaagg 730 740 750 760 770 780 790 800 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ** * *** ** *** **** * * ******** * * ** -----------------TTgTAtTtcTGG-TAgcACT--GCTGcT--------GtTGTAGCTTtTtT-----------TA ggatgggtataatggca c c ca c aa aa a tctacatg c g c gggtttaataa 810 820 830 840 850 860 870 880 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** * CTTtT--------------------------------------------------------------------------- g gtagaagcttgggggcaagttagtgtgaggggttgtagtttttatgcatgctggattgcaacatcaggtagggtc 890 900 910 920 930 940 950 960 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** ** ** ** ** **** ---------------------------------------------------ATAtTGgATgAAt---------GGgTCCG aagagtcagttgtctgtgaagaaatgcatgtttgagagatgtaatcttggc c a a ggtgaagcaa a 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** **** * ***** ****** * * * **** CC---------------AAAC---CtgCTTCAtt------AAGGGAtAtG----------------------tTtTGGAt actgcgcagctacag tgg ca gcctaata a c ccagtgtgaagcataatatgatc g c 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** * ** ** ** *** * **** * * -TTCgtAtgAGcgGCtTTg------------------TGGtGgACATtGcAg---------------------------- a aa gc aa c atcagatgctgacctgcgc a a g a atattcttgctaccgtgcatatcgtttcc 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** **** ** *** * *** * ***** ---GCtCGCAgGA-------------TGAggAtAATgT--GATTA----------------------------------- cat a a aatggcctgtatt ac c c ta ccaagtgcaccatgcacataggtggtcgcagggga 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ****** * **** ** * ** * ----------CTtgCCAGTGtA-----------------------------------GCCTt--------TGgGctTAgC atgtttatgc ga c acatgaatcatgtgaaggtgatgttggaaccagat cttccagag a ag a 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** *** ****** *** * * * ** *** * AGG------------------------------GATcCTGAGAt-------------ACCgAggGtgCgtGCctGCGgtT aatctttgatatgaatattcaactatggaa a catgatgacactaa c cc gc ac aa aa 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ***** **** ** * ** * * **** *** *** gtGGAGGcggg-----------gCAGCcGGtG---------------GAcgAtCtGAGAgCCG--------------GCC cc aaaacatgctagattc a a tgcgtggatgtgact aa c c c atcatttggtgctt 1450 1460 1470 1480 ....:....|....:....|....:....|....:....|....: ** ** ** **** * ** ** TGgACt--------------tTCtgGTGGtGgAG--------TAg c cggagcggagttcggc ca a a aaactgac a |