Dataset for CDS other cellular homologs of organism Stomoxys calcitrans

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*** * **     ***  *              ****    **  *    **  * ***                     
ATGcCtTCgccacCGTccAcgccacgtttacgcAAAAc-tcCAccActgtTTccGcCAAc--------------------
   g c  cggct   at -----------acg    taat  aa t-tc  at g   tgctaattataatccaaattt

        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
        * * ***      ** ** * *     **                            ****** *  *  * 
--------CcCgAAActagccCGtGCcAaActaaaATcttcatccttagatcatgagatattcctAACCAAaAccAccAg
tttgcaac g c   tattaa  a  g t tagcc  ac------------------------gc      g ag aa t

       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
   *  *   *  ** * ** **   * **         ** * *     ** *  ** *  ***   * **    *  *
ccgGccTaaaCatCAtCtTAgACaatTgCAgagcagcacTTcGgTagaatGGcAacAAtTacAATcctCcCTtaccAtaC
tta tt tcc gc  c c  c  tca c  --------a  t c -----  a gt  g ca   atc a  -cga gg 

       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
   *    * *  *         * *    ** * *  * **     **** *  *  ***       **         *
cacGcaccGgAtcGacttcctcaTtGgccaGCaGtAcaTtTCaatatCCATtGacAgtGAAtaattatCAtgatttcaaA
--g ttga t at tgggggatg g taac  g a ac a  ctaca    a -g tg   ggcggca  gataccagc 

       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
 * ** ** **    *****    ** ******** ** ** ***       * **  * **  ****  * ** ***  
aAcGAcATcATcaatCAGGGaaaaTGtCTTTGTGGaCAaTAcATAcgggctaGaCTgaGaCGagCAGGagTtTTaAATcg
c a  t  a  atcg     tcgt  c        c  g  t   aaaagac t  ac t  tt    tc a  c   aa

       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
 **   **   * **  * ** *************   * **  *        *****   ***** ** ** **  ***
cAA---GGccaTaCAaaGaATgCGCAGCATATTGGagcCaTCttCtgaa---tTGGTTtacGAAGTcTTtCCaGCctTAA
g  att  gtt g  gc c  a             gta c  ga catgtcgg     cgt     t  c  c  tg   

       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
      * ** ** **  ******* ******** ** ********    **  *  * *** *** *** *  **   *
atagtaTgGGcGAaGAgcTGGAACGgATGCATCCtCGaATTTACACaaacGTctCgcGcCAAtTATcCCGcAcgCCataC
tggtgt a  t  c  at       c        c  c        tggt  gg ca a   a   g   t at  tgg 

       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
***** **          ***** *    * *  *  * * *   ******* * *******                  
GGTGAgTTggtggacagtGATACaGctccTaTgcTgcTaAaTctgGTGGCCAaAcAACTCTTctcgcgaagtacagcgga
     a  tcaatctgcc     t taat t at ag c g gct       g g       tcgatt------------

       650       660       670       680       690       700       710       720
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
          ** ** ***   ****** ****  ******** *   ******* ** ** * ******** *******
aagggaacgcATcACaTGGgccAAAATTaTTTCagTATTTGCCgTatgCGGTGGTtTTgCCaTcGATTGTGTgCGTCAGG
------ggat  a  c   agt      g    ct        a tgc       c  t  g g        t       

       730       740       750       760       770       780       790       800
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
****   *** *** *** *   **  ** *  ****    **  **** ******** ***** * **** *    ** 
GTCActaCGAtTATcTGCaAtgcCTggTGgAtgGTGTgggcGAaaTAATcGAAGACGAtTTGGTcCaTTGGcTggtgGAg
    tcc   g   t   c aaa  aa  c aa    atcg  tg    a        a     g c    a caat  a

       810       820       830       840       850       860       870       880
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  ********** * *** *  *  * **  *     ***   ** ******** * *        * ** ***   ***
cgTGGCGGTTGGtTgGGCcTgcAacAgCAtaTaaaacCCAaagGGtCACAAACAtTcTctt--ttcTcGAtTGGttaACT
aa          g t   a ca ca c  cg -----   tcc  c        c t gaatccct g  a   act   

       890       900       910       920       930       940       950       960
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
 *  * ** *  *     *            * **** ****     * ** ** *  * * * *  *  ** ** * * 
cTctTcGTaGcgAtctcaTc-----------TgGTTTtTATGccgtaAcGAaTTtTgtTaAaCaAatTggTTgCAgAgTc
a aa t  t gc gtatt ttggcttagtat a    a    ttcat a  t  c ta c c t cc aa  c  a a t

       970       980      
....:....|....:....|....:.
         * * ***       ** 
--------tAtTcGTTaatatttTAg
atacgaccg g t   ggc-aaa  a
© 1998-2024Centre National de la Recherche Scientifique logoInstitut national de la sante et de la recherche médicale logoUniversité de Lyon logoLegal notice