Dataset for CDS BID-like of organism Sparus aurata

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*** *    *          ****   ** *****  *  ***     *  * ***  ** *   *** **  *   * *
ATGtCtgcgT---------cCTCTtctGCtTCCATttCttCCAtttttCttGtGGAttTCcAttcTGAgACccAtttCgT
   g aaac caggctctaa    gac  c     ca ca   ccgcg cg a   ga  a gga   a  aa gca a 

        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
    ****                                                    ** ** **  ***  ** * 
---tCTCA---------------------------------------------------gAGcTTtCCtgAATggGAgAg
tgtc    actacctgggaatgctgcctgttggtagatcacaggccaccacagctcaaga  a  c  ac   ca  c c

       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
 *   * * *  *** * * **  * ** ****   *** **   * *                           ** * 
tGtggAtCcCccTGAtAgA-AGtgCtGGtAGAGtggGAGgTGcctAcAgt-------------------------TCtAg
a acc c a aa   c a g  gc a  c    gaa   c  aaa a cgggaagatgaaatcgctgactctttt  c c

       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  *  ****  **  **   **  ** *                                                    
tgCtgGCTTtgACtgACcccCAtcGCtGg---------------------------------------------------
aa aa    ca  cc  aaa  aa  a atgtttaatccggccaacccagagacctccattgaagactgcctcgctgcag

       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                                                                
--------------------------------------------------------------------------------
tgggagaccaggtggccagagagcttgatgcacacctggcggcagcagtagacgcactcctcgcagggcccttggactac

       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                 ***      * *    *  ** **** **                  
---------------------------------ATActgggtCgGgttgGctGGcGCAAgGT------------------
cagagattcagagacacagcactggatctctca   aacaca a cgac aa  a    a  gctagtgcctttggtgct

       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                                       **  * *    *** *** *  *  
-------------------------------------------------------GTgcGtTttgtAGAtGAGgAggAgg
gctccaggctttacaaagtgaaggccagtcactggcaactctgttgcatctgggg  ca c cccc   g   a ca aa

       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
****** **             ****    ** *** *     *     ** ***  * **** *  *** **    ***
CTGGATtCA-------------GGGAtttcGTtAAAtAtctggCttttcGTcAGAtgAgGAGCgAggTGTcAC----GCC
      a  tcattcagcaagg    cgga  c   c gacac ccaga  a   cc a    a ac   a  catc   

       650       660       670       680       690       700       710       720
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  ***  ****  * *   *  * *  **        **** ** * * *   * *  * ** ** ****          
tcAGAggGCAAcgAgAtctA--CtTgtTC------gcGCAGgATgAtGcCctgCtCcgCtCTtCCtCATCgg------gc
ga   ca    ac c aaa aa a cc  tctgggca    c  c c a aaa c ac c  c  a    actgctctaa

       730       740       750       760       770       780       790       800
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  **  *****    *   ***  * *     * **    *  ***** *  ** *  ***   *               
gcTGgtGACAAtgggAgtgAGCttAgCtcctgGcAG----AcgGAAAGcTttCCtGttTCTttgGg--------------
aa  aa     caac aga   ag a caaaa a  ataa aa     a ca  a gg   cca caggccacgagtctt

       810       820       830       840       850       860       870       880
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                          * * *  *  ***  * * *   **  *** **  *** ***   *      * 
--------------------------GgAgAgtTcgAGAggCtGgAgggCAgtGAG-GGtgTGGcTCTggtCggg---Gg
gggcacaggtcggtgtgatggaccct a a cg aa   ac a a caa  aa   g  cc   a   cac cacaaa a

       890       900       910       920       930       940       950       960
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
 * **   *   *  **   * **   *  * * * *** * ** *  **           * * *  *  ***     *
gCtAAgcgAgttTccCTtgtCgAA---CtcG-GcCtTTGtCgAC-TctAGtgtgtggc-gcCgAgCtgCttGAGttcttC
c g  aac caa aa  cca a  aat ca a a a   c c  g ag  ccccaccaaaa c c cc cc   gaagg 

       970       980       990      1000      1010      1020      1030      1040
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
* ****** ****  * *  *** *  **                                                   
GgTGAAGTgGCAGggAtAgtGGAtAggATtgt------------------------------------------------
 a      a    ca a ca   g ac  gacgagtgttttagggacagagagtgagctggctgagctcagggaagaatt

      1050      1060      1070      1080      1090      1100      1110      1120
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
      *  ** *********             **  * ** *** * * * *****  *  *          * **  
-----gCcgGAgTCCACCTGTtgt--------ccGAggCtGAgTCCtCcAgCtCAGCCtgCgtGtttt-----gAgGAtg
tagggc aa  c         accagagtcagaa  aa a  c   g a c c     ac cg cgagcactaa a  gc

      1130      1140      1150      1160      1170      1180      1190      1200
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
**** **     **     **   *  * ***   **  *   * *        ** ** * **   * *  ***  ** 
CAGTtGTtctcgAGcttgtTGcgtTgtTgTCTttgGA--GcggTtCtttctttcCTcAG-AtCAgttCtGctCCCttCCt
    g  gaaac  acgcc  aag cc c   gca  gg aca c cacaaaca  a  a c  aag a ac   cc  g

      1210      1220      1230      1240      1250      1260      1270      1280
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
 ***   ****  *      *    ** *  * *  *** *     *  **  *   * *** ****** *    **  *
tCGCtgcAGCTtcT------CctgtCTtTgcTcCggAACcTttggtAcgCTtcTgtgTtCCTtCAGTAGcAgtcgAGtcT
g   aca    ga gcaccc accc  c ca a ac   a ccacc ac  ga cga a   g      a ccaa  ca 

      1290      1300      1310      1320      1330      1340      1350      1360
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  *   **** ****     *  ** *   * *                                               
gtG---CCAGcACCA---tgCgcCCcTgcgCtA-----------------------------------------------
ca agg    a    gctgc ca  a cac c gtgcctgctgagatggcacccccatctctagctaaggaagccccgga

      1370      1380      1390      1400      1410      1420      1430      1440
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                        * **  **     * *    * *   **** *  ***                 **
-----------------------gTtCAgcACtggccCgTgtggCtGtttCCATgGtgGTAt---------------cAC
agaaccagcagagcctgaagccac c  aa  cacaa c aaac a aga    c ac   gtgcctccccagccaga  

      1450      1460      1470      1480      1490      1500      1510      1520
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
    **  *** **                                                       *  *** *   
ggggGAttGTGgCAg------------------------------------------------------CccCAGgTgcg
caca  ca   a  aagccggagatcccgttggctgcacccttaatcccagaagcccctgtagaagaag aa   c aac

      1530      1540      1550      1560      1570      1580      1590      1600
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
 ***  *   *        ******     **  **** *        **    * *****  *     ****** * **
gAGCggAtggAgggctcttCAGAGTt----CTttATGGcG------tcCTttggGtCCTGG--CtggtgTCATGGcGtAT
c   ac cac accagaag      gcctg  ac    a gtgctgca  ggcc c     gt aacaa      a g  

      1610      1620      1630     
....:....|....:....|....:....|....:
**    **  * ** *   ***        * *  
GGtctcATgtGgTAgAggtGGA--------AgTgg
  gaaa  aa c  c caa   ggagtatg c aa
© 1998-2024Centre National de la Recherche Scientifique logoInstitut national de la sante et de la recherche médicale logoUniversité de Lyon logoLegal notice