Dataset for CDS BID-like of organism Strigops habroptila

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
***                                                                             
ATGgcgtg-atc-a--g-t-tg-c--g--gga-t---ct-tg-----aaatac-t--t----agc-ac-tg-----t--g
   tacccgcg-t-tt-c-g--t-ct-tt---t-ttg--c--ggccg------g-gg-tgtc---t--c--ggggt-tt-
     aaa    a cg a c  c  a aa   g gca  a  aaaaa        aa gcaa   a  a  caacc ac 

        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                            *                          * *   *  *   *    *   *  
-c----gagaagcc-c-g--g-a--c-gCtgttcag-------ctacctggcaatAtCctcTtgCtgtAcatgCattGgg
t-tgtg--------t-g-tg-g-tg-tc acggtccacacaagggtttcaaaggg g tca ga acg aggt tgg aa
g acaa        a a ga c cc g   aca  a        c   a     c          a       aa   

       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  *      *                                                                      
caAagagatTt--g---a--t------ag---tc---gag--gctg--a-a-c---a-g---------------------
gc ctgcgg gtt-ggg-tc-tcgtct--cgt--gct---gt----tg-c-t-ttg-t-aagaaatcttggaagcattta
      a c ccg aaa ga aaaaaa  aaa  cag   ca    aa a a cca a                      

       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                         *  *          *   ***         *        
--ac-ac---a--tga--gcca-a---c-c--g-g---ag-CctGctaagctagaGggtTCAataggagacTgcctg---
gc--t--ttg-tt---gt----g-gtt-g-gg-t-ttc--t aa -cggctggcc ctg   gagaccatg tgtgcgct
ca  c  agc gg   ca    c cgg c ca a ga   g     a  a c    a c       a         aaag

       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                     ** * **        **   *     * * *          *  *              
-att-g-g-g--a-a-a--gtCCcAtGAagtt-gaaGAgcaTctgccCaAaGcactgcagagCtgGct-ag------g-t
t---t-t-g-cc-g-c-gtcc  t g  ttgagccg  agt gcaaa g t gcaatgg--c gt a-t--gctttg-g-
c   c g c    a a ca      a    a  a         a                        g  caagcc a 

       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
      *   *                                                             *       
ga-a-tAtcaAgaat--c-g-gag--c-c--aagag----c-g--c-----ag---a-----aa-aa--tctTggta--c
--tgac ggc atc-ct-g-g---gt-t-tc-----gcgg-t-cg-ctgcg--tgg-tgcgg--t--gg--- cccgcg-
  c            ac   a   cg a aa     aaac a ac acaac  gaa a  ac  a  ac        ac 

       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  *    **   *     *       *     *   *  **      *                                
ctGtttcTGgttCagaagTttctg--AtgtagTtttCcaGAtgagtcCtg-g-acca------------g--aa---tgg
ac gact  ccc tccgc gcactaa ctgcc cga ag  ccgtgg c-a-g----ctgagtgcggtt-tg--ctt---
 a c     a a  a  a a         a    a      a      a   a             caa ga  acg   

       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                * * *   *                                      *
gg--a-a-a---ag-aga---at-c---agc-GcTcAtatC--t-a--------gat-gg-gac----tt-a----g-aA
--tg-c-t-tct--g---act--t-caa---t a t gcg tt-c-acgctggg---t--g---ggtt--t-tttt-g- 
  ca a a caa  a    ag  g       a     c   ac a   aag aa   g  a   cagc  g caaa a  

       650       660       670       680       690       700       710       720
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
**  *    *   *  *             *   * *       * **  *       *         ** * *  *   
TCagAagaaGaatA--Gtac-gtggtctagTcgaGcAcgtcctcAaTGacAtt-atatCctgagagggGAtAaCtcGgca
  ca gcgg cgg aa agatccaaggccc gcc g gtatagg t  cg ggtcgcg taccccaac  g c cg cgt
            a       ca   a   a            c        acc c       a   a  c         

       730       740       750       760       770       780       790       800
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
** *                                  *  * **   * ** *   **                     
CAtGtg-g----------tcc--ca-g--g--cacg-gGtgGcAG-tgGgAGaGcctGCacg------------------
  g acg-ttccccattg---tt--c-gt-cc----tc ga g  aac a  g ata  cg-tgtccctgtcagcgagcc
  a  aa cc     gac   cc  a aa aa    ga                      a                 

       810       820       830       840       850       860       870       880
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                                                                
--------------------------------ctggg-c--g-g-c--g--a-c-agt-gcc-t--at---g--------
agagctggcacacagagagcctgccagtctcc-----g-gc-g-t-ct-gg-g-c---t---t-gg--tgt-gcgcgtcc
                                     a ca a c aa ac c a   g   a cc  ccc aaaa    

       890       900       910       920       930       940       950       960
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
        ***    *  **        **   **                                             
ag-c---aGCCatgcCagCAg---acgtGGagcAG-----------gataa---tt-c-ac-ca------gt---cg--g
--t-tcc-   tgca ct  acggcgag  tca  agaggagcgagccgg-ttg--c-t--t--gatctc--ttc--tg-
  g aaa     ca             a                  a c  cgc  a a  g     aga  cca  aa 

       970       980       990      1000      1010      1020      1030      1040
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                                       *      **    *           
aga--g----gat---g-aggg-a---------------tg--agcc-g-g--gcAgagcatGTggatGctaggatt--c
---tg-gggt---tgt-g----g-ttgaggaggcagtgg--gg----g-g-gt-- cgcacc  tcgg tggtctgcgg-
   ac aaca   acc c    c g                ac    a c ca   a             a    a c  

      1050      1060      1070      1080      1090      1100      1110      1120
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                       *    *                   *      ****    *
ca-g-----cc-gc-cc------g--g-t-aa-cc--c-GtagaAact--------tg--aattCacttccCTCCgtacT
--c-gctgg--t--t--tttggg-tc-g-g--g--tt-c gctt tt-gctgctgt--cc--gg gaggtg    cgtg 
    aaccc  a  a  gacaca ga a a  a  ac a         aaaaaaac  aa  aa   ac       c   

      1130      1140      1150      1160      1170      1180      1190      1200
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
**       * *                                                    *               
GCagc----GtGct--acagg--gg--aagg--ga----cggct--aga--tt-tt-a---ac-Tg-----c---t--t-
  ttgagat a tcgg-----ca--tg----aa--tgcg-----gc---gg--g--g-gag--c -tcctc-cgg-ct-t
             aaa     a   aa        aaaa     aa   cc  c  c      a  aaaca acc ac a

      1210      1220      1230      1240      1250      1260      1270      1280
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                                                                
----aacctg-c--a----ta---cc-t-ag-a-a--a-----ca-caga-cc---g------------------a-t--
cgtg------t-tg-tggt--tgt--g-c--g-g-tg-ggctg--g----c--tgt-tcaaccccgaagagatcc-g-tt
aaaa      g cc aacc  gcc  a a  a a aa c aac  c    a  gaa a                a a ac

      1290      1300      1310      1320      1330      1340      1350      1360
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                                                    *    *  *   
--cttc-cag-g-a----a--g---gg---g-ggg-----------------a---g-aacc------TgaacAggAtta
tg----a---t-g-cctc-ct-tgg--gtg-c---tcggttggaagaaatgg-tgt-c----ctgtgg tcgg cc gcg
gc        g c aaaa ag cca  aaa a                   c aca a    agccac         ca 

      1370      1380      1390      1400      1410      1420      1430      1440
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
    *     *  *    *      *    *   ***                                           
tg-gCttcttCagCcgccAgc-tggAgaacTacaTTGc----t-gt----c-gc-g---t--cca-a---g--g-ag---
--ga caagg tc tagt caagcc cgtt ctt   -tgtc-t--ggtg-t--t-cgt-gt---t-ctt-ct-t--cgg
  a     ac  a      a      a           acca g  ccga a  a aag cg   g aca a  a  aac

      1450      1460      1470    
....:....|....:....|....:....|....
               *      *      * * *
t---ag-ag-g-t-gCtg--tgAggcgggAgTgA
-tgg--t--c-c-gc gctgat tcacca c a 
   c  c  a a aa a aa      aa      
© 1998-2024Centre National de la Recherche Scientifique logoInstitut national de la sante et de la recherche médicale logoUniversité de Lyon logoLegal notice