Dataset for CDS herpesviridae of organism Panine gammaherpesvirus 1

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
***     *  * *       * *** * *  ** *** * ** **  *     ** *    *    *   * * **  *
ATGggg-tAttCgAg------TcTACtGtT-tCCgTGTtTgTGcGGgcCcgtttCGtGgcttGggttGggtCtTtGCctC
   acccc gc a caaggga a   a a ag  c   g a  a  aa acgga  a cagg aaac cac g c  ag 

        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
* *      ** * **                                                * * ***    *   *
CtGtgttggAGgTgGCc-----------------------------------------------GgAtGAGtcggA---C
 g acgaca  c a  agagtccagctacctcatgttcagggcaatgtacgcggtgttctcccg c a   aaac cct 

       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
**  ** * **      * * *****     ** * *  *    *  **  ** ***  *   ***   * ** **    
CTggCGtTtCCggcggcGgTcCTGTGg--ttGCtGtTccAtttgTtgCTtgAGgAGGtcAttcAGCtgtAtGCgGAgttg
  cc  c g  ccacaa a a     cttcg  g a aa ggcc cc  ga  a   aa gaa   aaa c  a  acca

       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
      ** **   *** *        *   ***** *         * *   *   *   *   ****** *  ** * 
ttttgcAAgACttgGGAgAtttttgtcAggcACGCTgAcgt------CgTggcCctgGtttTtggCGCTGTgTttGAcG-
gccaca  c  ggc   c cagggaga caa     c acaccagct a caa agc acc gcc      a ac  a a

       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                     * * **  * * *  * * ** *  * **   *   * *** * *  *  **   *** 
---------------------AtCcCTtgGgCtAgtGtTgGCgTgtCtGGgttGttgTgTGC-TgCctGgtGGtgtTTGt
tatatttcaccgtggagatcc c a  gc a g cc g c  c cg a  ccg ggc a   a a ac ca  aca   c

       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*  *  *    * *        *   *  *** * *  **  *  * ***   *  *    *  *   * **** *    
GgtGggAccctAcCtgtctttcCtctGttGTGgAgCttTCgtTttGtGGGctgTt-GccgcCtgCgtgGgCCTGtAtggt
 ca ca aaag a acgacgaa aaa aa   c c cg  ag cc g   aca cg aaca aa caa c    g cccc

       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
 *    *  *     *** ***  ** *  * * *  * *  * *** *   *  * *               *** * *
tGgc-tTggTt-gcgAGGgTGGgtGG-CttGtCtAgtTcGgtGcGACtCtctTtgCtC-------------ttGACtTtG
a aatc ca ctaac   a   cc  a ag c a aa a ca a   g cag gc c cacaaactctagagg   a g 

       570       580       590       600       610       620       630  
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|..
    * ***** *****       ***  *  * *                                  ***
gtttTtGCCGGcCTGACtttgtttCTGttA--TgTt-------------------------------tgTAA
ccga g     a     cgacagc   aa at c atgtagctatttatttatctctagaggaagacac   
© 1998-2024Centre National de la Recherche Scientifique logoInstitut national de la sante et de la recherche médicale logoUniversité de Lyon logoLegal notice