Dataset for CDS BID-like of organism Mastacembelus armatus

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*** *    ** *      *  * **   **  ** *  *  * *     ****  *   *** * ***     *    *
ATGtCtgctTCtGgctgc-CgtTgTCtgtCTgtCTtCttGttCtCttgggTTTCtcTtg-TGAgAtCAAg--gcTtgtgC
   g acag  g cagcaa cc c  ccc  cg  c cc ag c gacca    ca gat   a c   ataca gaaa 

        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*** **       * * ** *  ***       * *  ** *  *   ***  *  **  * *   ** *   *** * *
TCAtCT-------AgTgCTgCctGCTttt--tgAtCggACcCttTcccTCCcgCttAAggAtAt-gCCtGgttGAGtGgG
   a  acctggg a c  c aa   ggcctac a ac  a ac aaa   ac cc  aa g ggc  a aaa   a a 

       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*   * ***     ** * ** *   * **    *      *    ** * ** * * **  * *  **    ***    
AggtGcCTAtcgtgATtAcAAcGcgtAtAGtt--Cg-----AgttcACtAgAAgAtGcAAtgAcTggGTggttTTCtcct
 aag a   gaaac  c a  a aag c  aaga cagctg aaca  a c  a a a  ac a ca  ccga   caag

       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
**                        **   ***** ****  *     **** ***  *** ***            **
ACt---------------------gtAGtttTCAGTtCAGCcgAtg--cAGAGgACTgtATTgAAGgcttt-------CA
  aggtgtcgaccaccacacatcaca  aag     c    aa ccaga    a   cg   c   aacgccttgctg  

       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
    ** ** *  * * *  * * **  **      **  ***   *   * *   **** *                  
ttggGAgACtGcgTgGtCgtAgAgCTtgACgcccctCTggCAGcggCtgtAcAc--ACTCcT-----------------t
aaaa  a  c ac c c ag c a  gc  caaaac  ac   aaa ccg a aac    a tgagggacctctggacta

       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  * **     *  ****** ** * *** *   * * *  ** *  ** * **   ***  * **    ***      *
ggAgAGgtttgGcgAGGCAAcACtGtCTCtCttcAgAgAt-CAtAcgGAtGtTGgttTCAttT-CTcgttCCT------C
cc c  agaca aa      a  c g   a gca c c cg  c aa  a a  aag   gg g  accg   ttggtg 

       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*** ****    *  * *   **                                         *  * *     * ***
TGCtTCAGgcttTgcTtGttgAAg----------------------------------------Gc-AgAggcggAtGAA
   a    aaga aa a gga  agccaacctgtgacaactctgttgcaactgggggtgcactt at c acaaa a   

       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
******   *      * ***  *  * *   * ***    ** *   *  *** ***  * *** *  ***        
GCTGACtctAttgt-cAgTTAggAggAtGgtgTgCAAt--cTTtAggtTtgAGTtAGAggAgGAGgGggGTG--------
      caa agcaca a   aa aa g agc c   gtta  c aac ga   c   aa a   a ac   tgaccatt

       650       660       670       680       690       700       710       720
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                        * **** *   **   *  **                   
---------------------------------------gAtCATCtTgttCAggtCttCC-------------------
gctgaagacagcaacgatatttacatcctgtcaggggagc g    c cac  acg ag  cccaatcgtccctggtctg

       730       740       750       760       770       780       790       800
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
        ****   ** * **** **   * *       *  ***   * * * **** * * *  **  **** **  
-------gACAAtctCAgTgAGCAgAGctgCtGgccgtccGccAGCtttCcTgTtTCCCtAtC-TggTCctGAGTtTTgt
cactggac    cag  a a    a  aac a aaacaaa aa   caa a c c    a g a cc  ac    c  ag

       810       820       830       840       850       860       870       880
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*   **** *  * ** *    *  *   ** * ***                                 *  *    * 
GctgAGGTtGgtGcGAtGgtggAtgAggtTGtCcAGAggttg----------------------------AgtAtcgtAg
 aac    a ca a  a cacc aa aaa  c a   acccagagagcaatgatggcatagctctggctg cg aaac a

       890       900       910       920       930       940       950       960
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
 ***  * *** ** *  *       ** ** *  * ** * ****  * *      ** * *** **            
tGAGtcCtACTgCTgAgtCtctgctgTCtTC-CtcGtAGtGtGTGAtgAcGcttcggTGgTgGAGgAGgtt---------
g   aa a   c  c aa caccaaa  g  a aa c  a c    aa a aagaac  c a   c  cgcagtgaagtc

       970       980       990      1000      1010      1020      1030      1040
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                           **      ****   *  * * *  ***  *  ****
-------------------------------------------GTtccgttGCTGtgtTtgGgGgGggATTttAtgAACA
gcagcgactgaggagagcatgatgagtgttttaggcacagaga  gaacgg    acc ca a a aa   ca gc    

      1050      1060      1070      1080      1090      1100      1110      1120
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
   *    ***  ******           * ***     * ** *   * * *   ** * **  **      ******
gttA-ctcCAGttAGACCC-----------CtTCCttggtTtCAcTctgGgAgGtctTTgTtATggATccttttCCAAGC
caa gaca   ac      cacagccccag c   cgcag c  a aga c c caa  c a  ac  aaaccg      

      1130      1140      1150      1160      1170      1180      1190      1200
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
** *    *    ***    ** **           *       * ********  * ** * *  ***  ***  *   
TTgTgggtA----CTTttctCAtCAgttcg------GtgtttccTgTCCCAGCTctAgAAtCgAttGCTcgTCCtcCtg-
  c caac gagc   ccag  g  cccaagaacca aaccgaa c        ac c  c c cg   ac   aa acc

      1210      1220      1230      1240      1250      1260      1270      1280
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
            ***  * * *  *  *   * ** * ***  ** ** *   * * *                      
------------TGCggCgCcTttCtgTgttCcTGgA-GTAtcACgACgGcttGtGtCt---------------------
tgaaccagaacc   aa a a gg ac cac a  c g   ga  c  a aca a a ggagccagaaccagctgctgcc

      1290      1300      1310      1320      1330      1340      1350      1360
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                        ***  * * * *** ***  * **   *  * ***  *  
---------------------------------------tCCAcgGgAgCtCAGcGCAtgCcAGgctAttCtGAAtgCtt
actgccccagtgcctgctgaggtggcatccccatttttag   aa a a c   a   ca a  cag gg a   gc aa

      1370      1380      1390      1400      1410      1420      1430      1440
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*                                                                               
Cttg----------------------------------------------------------------------------
 acagagccaggtcaggaacctgaacagccggagcctgatgcagtgcttccccagccaaaaccagatactgtggcagagc

      1450      1460      1470      1480      1490      1500      1510      1520
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                                                *   *   **** ***
----------------------------------------------------------------GcgtCtttTGTCcCCT
cagctcaggcccagctggctgcacccatggcctcagaggctgcagaggaagtcccagctgagga aca cag    a   

      1530      1540      1550      1560      1570      1580      1590      1600
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
* ***   * *              **    ****  *   ****                      ***** **  *  
GgGTCgggAtCc------------cTGgtttATGGggG---AATG----------------------TGGCAtATttTtt
 a   aac g agagctcacagtga  cagg    aa ggt    ctgatggtcctggccactgtaa     g  gc ga

      1610      1620  
....:....|....:....|..
 *       *  *    * *  
tGtccgttcCggGtgggAcTgg
g aaacgga aa aaca a aa
© 1998-2024Centre National de la Recherche Scientifique logoInstitut national de la sante et de la recherche médicale logoUniversité de Lyon logoLegal notice