Dataset for CDS BID-like of organism Acanthochromis polyacanthus

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
***   *  *  ****  **  *      * *          *** ** *  *** *   *  * **   ** *   ***
ATG---GctAtgTCGGggTCtgCctgttgTtC---------gTCCgTCtCgtCCGtCtttCttGtGGgttTCcAttcTGA
   tta ag cc    ac  ca agcacc g ctcggtctcc   a  a cg   c gcg cg a  agg  a aga   

        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
 **       **  *                       * * ** **   *    * **    ****** *   ****  
gACtcgtttgGTtgTt----------------------CtGgCGtTCgttC-ctgGgACccttTCTGTCtCccgGAGAtg
a  caaacac  cc ccttaactacctgggaatgctgc a c  g  cac aaac c  aagc      c aac    ga

       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
 * *    ** **      * ** * * ********     ** * *   *  *    *    ****  * * *******
tCgAgcttGCgAGgt---cGgGGgCtAgAATGATTAccg--AGtAgAtctAggAcgcgCtgcgACGAgtGgAgGATGAAA
c c caag  c  agagga a  c c c        aaaca  c c gag ca acaa aaac    cc a a       

       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  * * *                              ** ****  * *** **** *  *                   
tgGcTtCt-----------------------------CAgGTCGctGgTGT-CAGCtCggCc------------------
gc a g ctctttttccagcacaggtttcgaccgcca  c    aa a   t    c aa aaacccagagagctccatt

       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                 **** **   * * **    *       *   * ** *  *****  **  * * * ** ** 
-----------------GATGgGAggtAgAtTG----Gctttct-GgccCtCAtCtgGCAGCttCCttGtAgAcACtCCt
gaagactgtctggctgc    a  aaa a g  acca agagaag aaa a  g aa     ag  gc c c a  a  g

       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
* * *                                                                           
CcCgGgg-------------------------------------------------------------------------
 a a cacctctggactttcagaaattcagagagacaacactggatctgtccacacacacacagggaggctggagcaagg

       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
               * **** * ** **  * ***  * * * *       ** **    *    *****   *     
---------------TgCTGCtCcAGtCCttAgAGAgtGcAgGtCcgtgtgtGAgGAttctGttgtATCTCggtCt----
tcgtcgtgccgttgc c    c a  a  ac c   ca a a g aaacgca  c  cgac ccag     caa agcgc

       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                         ** *****     * ** ***** * ****    **                   
-------------------------TCtTCATCtggggAgGAgGATGGtGtGAAGtgttCAgtgt---------------
tacctggaggaagacgaagctgcct  a     caaca a  a     g a    aaac  cacaggtgtcagaggagga

       650       660       670       680       690       700       710       720
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  ** **   **** **    *   *  ** *   ****  * **                            *  ** *
-cGAgGCttgACCAtCGgttcA--gAgcAAgGctcTCTAcgTtCT----------------------------CtcAGgG
ga  a  gga    a  caga gac aa  c aca    aa c  tcaagttaaagttggagaaggaaaagac aa  a 

       730       740       750       760       770       780       790       800
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
**  *     *  * *  *  ** *** ** * *  * * *   **  *               ******    *  ***
GAgcAtgtttCtgAtCcgCtgAGcCCTtCGtCtTtgCtGcTctgCAccG--------------gAGCAGAggttCtgGCA
  ca ccagc gc g ac ac  a   c  a g ca c a aga  aa gagagaacagcagca      accc ca   

       810       820       830       840       850       860       870       880
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
****  *    * **  *    *        *  **** **     ***** * *  ** *       *    * * ***
GACAttAtgttTcCCggTgtttC-------tCctGAGTtCTggggtCAGGTtGgAgtGAtGgttgctgAggttGtCcAGA
    ga accc a  aa cacc tggccggc ac    c  acaca     a c aa  a cagcacc aaac c a   

       890       900       910       920       930       940       950       960
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  *    ***** *                              **** * * ****  * ***   ** *  *  *   
ggTtggcCAGCAtCg----------------------------cGAGAcCgAgTCCTccAgCTCcgtCAtTgtCcgCgtt
ac ccaa     a aagggcgtggctctggctgaggagcgcaga    a a c    aa a   aaa  c ac aa agg

       970       980       990      1000      1010      1020      1030      1040
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
    * **  * * *  * ** ** ** **   *                                              
g--tGtGAtgAgGcGgtGgTGgTGgAGgAAgtgG----------------------------------------------
cagc a  ga a a ca c  c  c  c  cgc gtgaaggcggggcgatagaagaaagcatgatgagcgttttaggcac

      1050      1060      1070      1080      1090      1100      1110      1120
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                    *****       ** **    *** **** *    * *   **   ** * **   * * 
-------------------tTCAGGttgttttTCtGGggggAGAtTCCAtCcgttCtAgggTCgggTCgGgCCggtTtCt
tgagagcgagctggccgagc     cacgaac  a  aacc   c    c aaca c aca  caa  a a  ccc g a

      1130      1140      1150      1160      1170      1180      1190      1200
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
   **** ** *   *  * *   **       **  * **     * *** *** *  *** ** **** ***      
gggCTCCgGCtTggtTggTgT-tcTT------gCCggTtGTtttcgAgACTtCTGgAcgCTT-TCtGCAGcACCttgg--
ccc    a  c ccc ca c tca  agaggaa  ca c  gagac a   c   c aa   g  a    a   gacctt

      1210      1220      1230      1240      1250      1260      1270      1280
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  * **    *  ****  ***** **                                                     
--TgTCgtcgGctCCAGcgCTGCCtCC-----------------------------------------------------
ca c  cgaa aa    aa     g  ccctgaagctcctgctccctctgaaccagaacctgcagcacctttacctgttc

      1290      1300      1310      1320      1330      1340      1350      1360
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                    * **** * *  *  ***       ** ** ** *  *      
----------------------------------tgCtGCCAgCgCccCggTGCgtggtgtGGtGGtCAgCctGgctgtg
ctgcagtagaaccagagcctgagccagaaccagcca c    c c aa ac   cccccaa  c  a  c ac cagcca

      1370      1380      1390      1400      1410      1420      1430      1440
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
 **  *  ** *    ***     ** ******                    * ****  * * *     ** ***** 
tCCcgGggGAtC--gtAACcggcgCCtGAACCC--------------------AgCGGAtgCgGgGctcttCTgAGTGCt
g  aa aa  c ccag   aacaa  g      acagcagaaccagcttctga c    gc a a acagg  c     c

      1450      1460      1470      1480      1490      1500      1510      1520
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
 ** * *  *                                                            *    * ** 
tCAtGtAgcA------------------------------------------------------------CttttCtCCc
a  a g ca gaagaaccccagatagaaccagagactgtggccgaccccgacgccacgctgagtgagcct cggg c  a

      1530      1540      1550      1560      1570      1580      1590      1600
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
 ** ** ***  * * *                                                               
tGGgTGcAGAggCcCgG---------------------------------------------------------------
a  c  a   aa a c gtagaggaggccctggggcagccggtcccagcatcagagctccaggtcctgctgtacagaggc

      1610      1620      1630      1640      1650      1660   
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|...
   *    ** *  * ***  * * *   *     *  **  *** *           * *  
--tGgcttGGcGgtCgTGGttGtTgTcgtG-ggtcCttCAtcATAcG-----------AgTgg
gca cacg  a aa c   cg c c aaa acaga gg  ga   a attgaggagga c aa
© 1998-2024Centre National de la Recherche Scientifique logoInstitut national de la sante et de la recherche médicale logoUniversité de Lyon logoLegal notice