Dataset for CDS BAX-like of organism Hydra vulgaris

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  **  *            *   *       * **   *           ***                           
atGGcaGaacatggttttaAtcgTatttgtgAtGAtttAgtaca--taacTAA-----c-gaaaa--t--t--g--g-tt
ga  tt ctgcatcaggcg agt cgcgcgc a  cga cat--gt--ga   tgctg-t-----cg-tt-tt-gt-t--
             a caa       a aaa     a        ag       aaaaa a     aa ag ac ca c  

        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                                    *      *                    
t-t-ta---a----ta---a--g--at--a-aaa---tc-t--ga-g--a--CtttcaaTtg----t-tc-ttact--c-
-g-c--tcg-cttt--gct-gt-tt--cg-t---tcg--t-gt--c-gc-gt cagagg --gctt-t--t-----tc-t
 a a  caa aggc  aaa aa aa  aa c   gac  c ca  a aa  a          caaa g  a     aa c

       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                                                                
-a---------t-gtga--taa-ag---tta-a-----------t-----tga-agt--t-----aac----a-a-a-tc
t-cgctgttct-t----gg---g--ctt---g-gaatatctgcg-gtttg---g---tc-tgctc---tgaa-g-g-t--
g ac        a    aa   c  aag   a          aa aaaga   a   aa gaaga        a a a  

       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                                                          *     
-tggt--a--c------------------t-g--------ggtg----a--aa-t-a-aaata----ca-g-gtTttttg
t----tt-tt-tcaaggcagttcaaattc-t-cttcgttt----gtgt-gt--t-g-t-----tcgt--t-t-- gccac
c    ag ga a                  a aggaacaa    acaa ac  a c a     caaa  a c    aa a

       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
 * *  *   *    *  *       *    *    *   *** ***      ***    *  **** *      * ***
aTtTaaTatgTcggtTacAaat----GatacAtatgAtttTGCtTATaatactTTTgttgAtgTTGCaAgacatcTtTTT
g a gt tac tcca ga c--taca taga ggaa agc   c   gcgcag   tcca ca    t atagag g   
         a  aa        a         c     a          a  a                         

       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*   ***  *   *    *** * *   ****  *  *  * *  ****      ** *  *  **    *  *  * * 
GaaaATGgcA--aTtaatTGGgGtCgtaTTGTttCtcTttTtTgtTTTGgttatgAAgTtgCttTTtaaaTtgTtaAgCa
 cgg   at ct- agca   a g aag    ag ct ga g ac    ccgtca  c ct ag  gccg aa cg c g
          ac           a         a     a           a   a     a  c             

       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
          *               *     *  *      *  *   **  *     **** *  **     *     
ttttgcattaGgg-ttg-a--attttT---gaAaaTattcagTttTttgGTtgAttttaTTGTtAaaGAaaaaaTtgctc
ggggcagggt --t---g-tc----- gcgcg gt gggtct gg ggt  gc caagt    g ct  cgggc attga
aaaca  c     c   c aa      aaaa      a        a       a        a              a 

       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
* ********  **   ** ** ***            *     * **         *     ** **            
AgTGGATTGCagAAcatGGaGGaTGGattgcagttcttGatt-tT-TTgatgaaactAgatgtCAgTTc-----------
 a        cc  agc  t  t   cagaatacgaaa tagag t  agctctcga ccgtg  a  tcgtactaatca
           a                               c      a       a   a                 

       650       660       670       680       690       700       710       720
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                           *  *   **  *                         
---------------------------------------tgatGtaTggtTTgaAggttt--t--t-----------t--
tatcttggccgctatggcaatatctgaactaactaatatgttg ag t-c  cc cccg-tt-tg-tgcttcactgg-tt
                                          a          a aa cg ga g         c ag

       730       740       750       760       
....:....|....:....|....:....|....:....|....:..
      *  *** *     *      *   *         *   *  
gatttaTaaTTGcTattgtT---ttgAtaaAatgttttcgAcgtTaa
ctggat ct   t tcaac tataga gcc cgtgcacac acc gg
   c           a           c    c  a   a   a   
© 1998-2024Centre National de la Recherche Scientifique logoInstitut national de la sante et de la recherche médicale logoUniversité de Lyon logoLegal notice