Dataset for CDS classical BH3-containing proteins of organism Pelodiscus sinensis

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
****  *   *  *   *                                    *  *    ** ** ** *  * *** 
ATGGgtCgggCcgGgtgC------------------------------------CtgGtcgcAGcCTtTTgTcgCgTGGc
    ag ccc aa cca gggccgggagctgcacaatcagtgcaggcgccgcgc gc aaca  a  a  c ac c   a

        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
 ***  *  ***   ** *  *                *       *  ****  *  * *   **** * ***  **  
gGGGgtGtcCGAtggCGtGttT----------------Cgg--tgtGctGACTttGggCtCcggGGTCtGgCTGgtGAgt
c   cg ga   gca  c gc gcccgattcccagctc acccgcg ag    cg aa g aca    a c   ag  aa

       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
**       *  *  *** ** **  **** *** * **  **    **                               
TG-------AgtCttACTgGCtTT--TTCAgACAgAgCCttTCttcgAG-------------------------------
  ctcttgg cc cg   c  a  tg    c   a a  aa  ggac  ttactctttggacgcaggaaaaggcgaccaa

       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
         *  *** ***    *  ****     * * **  * *   **    * * ***               ** 
---------CtgCCTtCTGgtgtGgtTTCAgct--TgCgACtgAgAcggTGgtgtGtTtCAGtt----------ctcAGt
atggcaaag aa   c   agca aa    aaggt c c  gc c aac  caca g c   gcaattgaaaggaca  g

       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
**  ** **** *   ***  **   *** * * **   *  *  *  * ***     *  * * ***  * **      
CAtgCTgAGCAtCt-gGACctGGggcCCCtAcCtCTctgCccAtcCtgTtCCActccgGgtGtCcTGTtgCtAT------
  gc  c    g ata   aa  caa   a a a  aaa aa ca ac a   agaaa aa c a   gc c  gtggag

       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                            ** **    * *   * *  * ** *  ****  **       ** ** ***
------------------------tcttTGgGActggTgGgtgCcGttTcCAtGtcCCCCttGTt----tcGCcTTtAAT
tcactgaagagccccagagactctgaga  c  aaac c aca a ac a  a aa    ca  cggctaa  a  g   

       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*   *                             * **** *  **** * *    *   *   * **    * * * **
CcttA-----------------------------CtTCCAgGt-GGAGtCtCggtcAgttCgtgAgGAcgtgCgGgCtGA
 agc tctaagtgcaatgggtaagcaagatcatg c    a ag    c c ccga aga acc a  aacc a c a  

       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  *   ******** * ** * * * * ** * ***  ****  *         ** * **   ** **  **    ** 
ggTttgGATTGCACgGgAGtTgCgGtGcATtGgAGAtgAGTTtcAtg-----tgCTgCcCAtgcAGgGGttTCttg-GAt
aa aca        a a  c a a c a  a c   cc    ca cacctctga  c a  aaa  a  ca  agca  a

       650       660       670       680       690       700       710       720
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
 *  ** **       *      **       *** **    ***** *    **** *  **                 
cAtcAAtCA-------AgtgtgtTGttttgtgCTTgTTttctTACATcAt-tgGCCTtAttTGt----------------
a ga  g  ataaacc ccaaag  gcagacc   c  gcac     a ctcc    c aa  gggaggcgaacaggaac

       730        
....:....|....:...
       *   *  ** *
------gGtctGcgGTgA
cacataa aaa aa  a 
© 1998-2024Centre National de la Recherche Scientifique logoInstitut national de la sante et de la recherche médicale logoUniversité de Lyon logoLegal notice